El género Vibrio comprende algunas especies patógenas causantes de vibriosis en humanos, representando un problema de salud pública y sanidad alimentaria por la emergencia de cepas epidémicas. En este estudio se analizó la diversidad genómica de Vibrio spp. provenientes de muestras clínicas y ambientales en zonas costeras del Atlántico y Pacífico Colombiano para identificar sus relaciones genéticas, haciendo énfasis en cepas con potencial de virulencia. Se secuenciaron los genomas completos de 64 aislamientos de Vibrio spp., los cuales se ensamblaron de novo y anotaron. Mediante clasificación taxonómica in silico, los aislamientos se identificaron como Vibrio vulnificus, V. alginolyticus, V. parahaemolyticus, V. diabolicus, V. furnissii y V. fluvialis. Se analizó el pangenoma de cada especie por separado y de Vibrio spp. para determinar diversificación intraespecífica y composición genética. Por especie, se identificaron en promedio 3624 genes del genoma central, que representaron entre 25% y 55% del total de genes. Las especies con mayor diversificación fueron V. parahaemolyticus y V. vulnificus con 11836 y 14406 genes totales, de los cuales el 68% y 79% son genes accesorios, respectivamente. El pangenoma de Vibrio spp. contiene 44418 genes, incluyendo 77 (0.2%) del genoma central y 44341 (99.8%) accesorios. Se encontró una alta diversificación indicada por una correlación positiva entre el número de genes nuevos y el número de genomas, demostrando que el pangenoma es abierto. En la mayoría de especies, se identificaron regiones genómicas únicas de algunos aislamientos, incluyendo plásmidos portadores de factores de virulencia y determinantes de resistencia antibiótica, lo cual confirma la importancia de eventos de transferencia horizontal en este género bacteriano. Los resultados demuestran la alta diversidad genómica de los aislamientos de Vibrio spp. recuperados en Colombia y contribuyen información genética que, junto con información de hábitat, permite identificar potenciales focos de vibriosis en el país.
Charla del día: 02/11/2020
Oradores/as: Alejandra María Pérez Duque
BioInformática
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