Ruas tol ini dibagi menjadi 2 bagian yaitu jalan tol yang siap operasi dan sudah dikenakan tarif. Dan tol fungsional yang sudah selesai dibangun namun belum berfungsi seluruhnya. Sehingga belum dikenakan biaya.
Ruas tol siap operasi sepanjang jalan Transjawa antara lain seksi Brebes Timur - Pemalang sepanjang 37 kilometer. Seksi Kartasura - Sragen sepanjang 21 kilometer. Sragen - Ngawi sepanjang 69 kilometer. Dan Ngawi - Nganjuk sepanjang 50 kilometer.
Sedangkan tol fungsional yang ada beroperasi mulai dari Batang, Jawa Tengah hingga ke Malang, Jawa Timur. Menurut Kementerian PUPR secara keseluruhan ada sekitar 760 kilometer jalan tol Transjawa yang dapat dilalui dalam mudik lebaran tahun ini.
