Το χωριό Καλλονή ονομαζόταν παλιότερα “Κελιά”, ονομασία που αποδίδεται στις αγροτικές κατοικίες (“κελιά” στην τοπική διάλεκτο) που συνιστούσαν τους οικισμούς της περιοχής ή στα κελιά των μοναχών που ζούσαν στο μοναστήρι της Αγίας Υπακοής.
Με απόφαση του κοινοτικού συμβουλίου που εγκρίθηκε με βασιλικό διάταγμα, το χωριό μετονομάστηκε σε Καλλονή.
Στον οικισμό διακρίνονται τρεις περιοχές: το Πάνω χωριό γύρω από την εκκλησία του Αγίου Ζαχαρία, τα Κουλπαριά όπως είναι γνωστό το κεντρικό τμήμα του χωριού και ο Καλοζάδος, το κάτω χωριό. Ο αρχικός πυρήνας του οικισμού υπήρξε το πάνω χωριό.
Η ενορία του χωριού είναι η εκκλησία του Αγίου Ζαχαρία. Τρίκλητη βασιλική, μία από τις μεγαλύτερες του νησιού, με όμορφη αυλή με βότσαλα, θα αποτελέσει ενδιαφέρουσα στάση της περιήγησής σας στο χωριό.
Ωραία βόλτα είναι και η διαδρομή προς το ξωκλήσι της Αγίας Υπακοής όπου θα απολαύσετετη θέα.
Στο χωριό παλιότερα λειτουργούσε και σχολή ταπητουργίας.
Στο Ηρώον, στην είσοδο του χωριού, αναγράφονται τα ονόματα των κατοίκων του χωριού που χάθηκαν στον πόλεμο κατά την περίοδο 1912-1922.
