Kawasan Taman Nasional Taka Bonerate terletak di laut Flores dengan jarak 79-206 mil sebelah Selatan Benteng, ibukota Kabupaten Selayar. Secara administratif pemerintahan terletak pada wilayah Kecamatan Takabonerate, Kabupaten Dati II Selayar, Propinsi Sulawesi Selatan. Terdapat sebanyak 21 buah pulau, di mana 6 buah pulau di antaranya dihuni oleh penduduk.
Kawasan ini merupakan karang atol terbesar ketiga di dunia (setelah Kwajifein di Kepulauan Marshal dan Suvadiva di Kepulauan Moldiva) dengan luas 220.000 hektar.
Topografi kawasan ini sangat unik dan menarik di mana atol yang terdiri dari gugusan pulau-pulau gusung dan rataan terumbu yang luas dan tenggelam membentuk pulau-pulau dengan jumlah yang cukup banyak. Di antara pulau-pulau terdapat selat-selat sempit yang dalam dan terjal. Sedangkan pada bagian permukaan rataan terumbu banyak terdapat kolam-kolam kecil yang dalam dikelilingi oleh terumbu karang, di mana pada saat air surut terendah akan tampak seperti daratan kering yang diselingi oleh genangan air yang membentuk kolam-kolam kecil. Pada bagian luar daerah atol, dikelilingi oleh massa air yang berwarna biru pekat yang merupakan perairan yang cukup dalam (lebih dari 1.500 meter) dan terjal.
Pulau-pulau di Taman Nasional Taka Bonerate berada pada ketinggian sekitar 3 -- 4 meter dpl, dan terdiri dari pulau-pulau kecil dengan bentuk memanjang utara ke selatan dan ukuran panjang 1,0 -- 1,8 km dan lebar antara 0,4 -- 0, 7 km, mendatar sampai agak datar tanpa topografi yang berarti. Jenis tanah berupa rogosol (entisol) dan terbentuk dari alluvium berupa endapan pasir pecahan terumbu karang dan batu pasir gamping. Tekstur tanah umumnya pasir sampai pasir berlempung.
Kondisi perairan di daerah ini dipengaruhi oleh musim barat (Januari-Maret) dan musim timur (Juli-September) yang diselingi oleh musim pancaroba (April-Juni dan Oktober-Desember).
website : www.tntakabonerate.com
