Los linfocitos T citotóxicos (CTL) tienen una acción citolítica MHC I y matan células infectadas mediante apoptosis. Las células diana para CTL incluyen células infectadas con virus, células infectadas con bacterias intracelulares, parásitos protozoarios y células cancerosas. Después de la respuesta contra la infección, la mayoría de estos CTL morirán, pero algunos se convertirán en células de memoria de larga duración.
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