Для того чтобы автоматически делать разные наценки в 1С Альфа-авто 6 можно использовать Ценовые группы.
Для каждой ценовой группы - вы можете составлять свою формулу расчета в Типе цен.
Далее для каждого товара назначается Ценовая группа и при Установке цен отрабатывает та наценка, которая была указанна.
Ещё видео!