Les problèmes de l'intégration régionale de l'Afrique ne sont un secret pour personne. Le commerce intraafricain est le plus faible du monde – environ 15 % contre 54 % dans la zone de libre-échange d'Amérique du Nord, 70 % au sein de l'Union européenne et 60 % en Asie. La complexité du paysage physique rend difficiles les liens entre les communautés, les pays, et même les régions.
Les marchés régionaux sont également très peu intégrés en ce qui concerne les services d'infrastructure, notamment d'électricité, d'énergie, d'eau et d'assainissement. Ceci est exacerbé par la faiblesse des communautés économiques régionales (CER) qui souffrent d'une insuffisance de capacités et sont mal structurées pour réaliser, voire attirer les investissements régionaux nécessaires. Les États fragiles sont particulièrement concernés par cette situation d'autant plus qu'ils sont les principaux bénéficiaires potentiels du renforcement de l'intégration.
