La malvagia regina Himika, risvegliatasi dal lungo sonno, chiama a raccolta i suoi ministri Ikima, Mimashi e Amaso, e dichiara l’intento di proseguire ciò che è stato interrotto 50 anni prima, ovvero lo sterminio del genere umano e la conquista della terra. Alla base antiatomica, Kenji, dopo aver curato le ferite della prima battaglia, inizia duri allenamenti con Kyo, mentre il dottor Shiba e Miwa lo istruiscono sul gravoso compito che lo aspetta. Alla base il ragazzo fa la conoscenza anche di Mitsuko, Monko e Tatsuko, tre ragazze abilissime piloti di tre caccia di supporto alla base soprannominate “gli Angeli”. Il mostro Aniwa appena sconfitto da Jeeg riprende improvvisamente vita e, alimentato dal potere della regina Himika, risorge molto più potente. Kenji non esita ad affrontarlo e, divenuto Jeeg, gli si scaglia addosso, ma durante la battaglia capisce che non basta il coraggio per contrastare un nemico così forte, ma serve anche intelligenza e attenzione. Individuata la sorgente dell’energia del mostro, Jeeg la distrugge, facendo poi a pezzi ciò che resta del nemico. Himika accetta la sconfitta con perplessità ma, resasi conto che anche questo Jeeg trae energia da una campana di bronzo, nascosta al suo interno, si entusiasma all'idea di conquistarla.
