El museo de la medicina se encuentra en las instalaciones de lo que fue el antiguo palacio de la inquisición.
Diferentes salas dan muestra de la tradición medicinal desde la época prehispánica hasta la medicina de nuestros días.
El museo cuenta con salas de exhibición permanente y exposiciones temporales, en las habitaciones alrededor del edificio tanto en la planta baja como en la planta alta.
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