Durante el gobierno de León Febres Cordero se crearon al interior de la Policía Nacional varias unidades especializadas en combatir a la subversión. Asimismo, se profesionalizó a aquellos departamentos ya existentes, como son:
UIES
Escuadrones volantes
SIC 10
Refuerzo de las Fuerzas Armadas
El origen de la creación de esta institución al interior de la Policía Nacional se remonta a los hechos que conformaron el secuestro y posterior muerte del banquero ecuatoriano Nahím Isaías, con ello, se hizo evidente la cimentación de una rama policial que permitiese erradicar cualquier acción terrorista.
Debido a la colaboración que prestó el Grupo Especial de Operaciones de la Policía de España (GEO) para terminar con la retención de Isaías, el presidente de aquella época León Febres Cordero consideró oportuno pedir al régimen de esa nación apoyo para la creación de una unidad de élite de similares características.
Según la Comisión de la Verdad, en primera instancia, esta entidad fue denominada como Unidad de Investigaciones Anti-Subversivas (UIAS) el 28 de septiembre de 1985 pero mediante el Decreto Ejecutivo Reservado Nº 1601 del 14 de febrero de 1986 se crea de forma oficial aunque secreta la Unidad de Investigaciones Especiales (UIES), como unidad orgánica del Servicio de Investigación Criminal de Pichincha (SIC-P),teniendo como base la Brigada de Automotores y en el Departamento de Delitos contra la Propiedad.
Las sedes de las operaciones se centraron en tres ciudades del Ecuador: Quito, Guayaquil e Ibarra, además, era autónoma en el campo financiero, informativo y operativo, dejando de lado la colaboración de las fuerzas de inteligencia militar.
