Constitué exclusivement d’images d’archives, le film évoque le parcours de Thomas Sankara et la politique qu’il conduisit à la tête du Burkina Faso au cours de la première révolution burkinabé entre 1983 et 1987. Réalisé 25 ans après l’assassinat de celui qui demeure une icône de la jeunesse africaine, Capitaine Thomas Sankara est à la fois le premier long métrage de Christophe Cupelin, et le premier long métrage consacré à Thomas Sankara.
