Pada dasarnya, prinsip kerja sistem injeksi adalah mengontrol aliran bahan bakar secara elektronik, mulai dari tangki hingga masuk ke ruang bakar.
Aliran bahan bakar ini diproses dalam bentuk kabut dengan volume, sesuai permintaan mesin sehingga teknologi ini lebih irit dari teknologi pengabut bahan bakar karburator.
Otak pengontrolnya adalah ECU (Engine Control Unit) atau di motor-motor Honda biasa disebut ECM (Engine Control Modul).
Nirmalnya ketika kunci kontak di posisi On, pompa bahan bakar atau fuel pump akan bekerja selama 2 detik untuk memberi tekanan pada selang bahan bakar kemudian mati, jika diluar ketentuan itu bisa jadi ada permasalahan di bagian ECM nya,
