Dalam penanganan dan antisipasi Covid-19, Pupuk Kaltim memberikan bantuan Extra Fooding berupa nasi boks, dilengkapi dengan susu, vitamin, buah-buahan dan makanan ringan, disalurkan ke RSUD Taman Husada Bontang, RSUD Abdul Wahab Sjahranie Samarinda dan RSUD dr. Kanujoso Djatiwibowo Balikpapan, sejak 20 Maret 2020 hingga 2 April 2020.
Selain itu, Pupuk Kaltim juga memberikan bantuan APD berupa Chemical Suit dan Safety Goggles untuk RSUD Taman Husada Bontang, serta pembersihan dengan penyemprotan disinfektan di fasilitas-fasilitas umum di sekitar Perusahaan. Penyemprotan disinfektan sudah dimulai sejak 21 Maret 2020, dimulai di Pelabuhan Pelni Kelurahan Loktuan dan nantinya, akan dilakukan secara bertahap di wilayah terdekat Perusahaan, yaitu Kelurahan Guntung dan Loktuan.
